卧龙苍天陨落的三周目和二周目在多个方面存在区别，具体如下：
难度设置
二周目：在首次完成剧情通关后，玩家可以开启二周目。二周目中，敌人的士气会提升，击败后会掉落5星装备。此外，二周目解锁了“升龙之道”难度，敌人士气阶级上限提升，但会掉落5星和有特殊效果的装备。
游戏内容
二周目：通关二周目后，玩家可以进行以下几项内容：
将所有武将的结义等级提升至上限。
击败最高难度下的BOSS。
获得全成就/白金奖杯。
获得所有称号。
收集所有金蝉之壳、简牍、啮铁。
找到所有牙旗和旌旗。
提升至角色满级（德）。
流程长度
二周目：二周目通关后，基本上目前所有的游戏内容就结束了，整个流程还是比较长的。
